Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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