Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD42Q8N9B4 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ANKRD42Q8N9B4 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms