Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
USP30Q70CQ3 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP30Q70CQ3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP30Q70CQ3 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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