Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RNF20Q5VTR2 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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