Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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