Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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