Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CNGA3Q16281 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CNGA3Q16281 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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