Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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E2F4Q16254 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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E2F4Q16254 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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E2F4Q16254 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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