Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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