Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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BRD3Q15059 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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BRD3Q15059 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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BRD3Q15059 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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BRD3Q15059 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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BRD3Q15059 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BRD3Q15059 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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BRD3Q15059 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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BRD3Q15059 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
BRD3Q15059 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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