Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ODF1Q14990 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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