Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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CAPRIN1Q14444 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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CAPRIN1Q14444 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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CAPRIN1Q14444 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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CAPRIN1Q14444 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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CAPRIN1Q14444 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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CAPRIN1Q14444 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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