Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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