Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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APOFQ13790 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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APOFQ13790 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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APOFQ13790 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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APOFQ13790 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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APOFQ13790 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
APOFQ13790 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
APOFQ13790 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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APOFQ13790 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
APOFQ13790 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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