Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4BQ13620 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4BQ13620 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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