Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEUROD1Q13562 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms