Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRPF4BQ13523 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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