Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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