Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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ERCC8Q13216 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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