Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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TRAF3Q13114 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF3Q13114 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF3Q13114 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF3Q13114 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF3Q13114 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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TRAF3Q13114 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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TRAF3Q13114 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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