Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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IFT88Q13099 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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IFT88Q13099 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFT88Q13099 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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