Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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