Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms