Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF2Q12947 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXF2Q12947 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF2Q12947 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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