Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LMAN2Q12907 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LMAN2Q12907 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LMAN2Q12907 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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