Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms