Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERFP50548 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ERFP50548 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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