Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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PTPRMP28827 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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PTPRMP28827 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRMP28827 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRMP28827 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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PTPRMP28827 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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PTPRMP28827 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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PTPRMP28827 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRMP28827 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRMP28827 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRMP28827 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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PTPRMP28827 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRMP28827 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRMP28827 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRMP28827 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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