Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPREP23469 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPREP23469 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPREP23469 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPREP23469 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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