Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTIFO43310 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTIFO43310 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTIFO43310 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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