Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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SH3BP4Q9P0V3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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