Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
UHRF1Q96T88 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UHRF1Q96T88 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms