Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBXN4Q92575 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBXN4Q92575 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.5 ms