Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NLRC3Q7RTR2 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms