Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TDRD12Q587J7 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TDRD12Q587J7 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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