Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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