Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCBQ16585 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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