Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP3Q15836 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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