Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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