Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SS18Q15532 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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SS18Q15532 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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SS18Q15532 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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SS18Q15532 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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SS18Q15532 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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