Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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