Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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