Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SPIDRQ14159 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SPIDRQ14159 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SPIDRQ14159 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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