Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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