Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NAE1Q13564 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NAE1Q13564 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms