Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TCIRG1Q13488 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TCIRG1Q13488 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TCIRG1Q13488 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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TCIRG1Q13488 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCIRG1Q13488 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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