Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP140Q13342 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SP140Q13342 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SP140Q13342 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SP140Q13342 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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