Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCGQ13326 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCGQ13326 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.9 ms