Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RIGQ13278 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RIGQ13278 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RIGQ13278 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
RIGQ13278 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RIGQ13278 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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