Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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